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臺達的EHPLC只有一個9針端口,怎么實現(xiàn)與在線電腦及觸摸屏同時連接?
如圖所示,EH自帶兩個通信口,一個是上面的插子,是COM2,RS485,一個是下面的圓口,是COM1,RS232,(這個是8針,不是9針),因此完全可以實現(xiàn)與電腦和觸摸屏同時通信。
另外還可以添加F485,F(xiàn)232擴展板,增加串口通信。
望采納。。。。。。
多糖的紫外光譜怎么看
經(jīng)過分級純化的多糖在測定結(jié)構(gòu)前須檢查其純度及測定分子量。
檢查純度最常用的判斷方法:
(1)用gc、hpLc測定組成多糖的單糖的摩爾比是否恒定。
用不同的柱型測定結(jié)果更為可靠。
(2)電泳只出現(xiàn)一條帶。
如可用聚丙烯酰胺凝膠電泳、乙酸纖維素薄膜電泳及玻璃纖維紙電泳。對于中性多糖可采用高壓電泳,以硼酸鹽為緩沖液,可增大其遷移速度。
(3)凝膠柱層析圖呈現(xiàn)對稱的單峰。若有“拖尾”現(xiàn)象,說明其均一性不夠好。陰離子交換層析純化
用DeAe一纖維素52(2.6x100cm)柱層析,0.lmol/Lnacl洗脫,流速6ml/h,按2ml一管分部收集,苯酚一硫酸法逐管檢測,繪制收集體積與糖含量之間的關(guān)系曲線??词欠裼袉我粚ΨQ峰。
按照Ye等報道,采用DeAe一52一纖維素交換柱層析法(2.6x30cm)對鮑氏層孔菌菌絲體粗多糖進行初步分離。DeAe一纖維素凝膠預(yù)處理:稱取DeAe一52一纖維素凝膠干粉,加入約10倍體積質(zhì)量比(ml/g)的0.5mol/Lna0h溶液浸泡30分鐘,倒出上清液,用大量去離子水反復(fù)浸洗至ph值近中性;再用相同體積的0.5mol/LhcI溶液浸泡30分鐘,倒出上清液,用大量去離子水反復(fù)浸洗至ph值近中性;最后用相同體積的0.5mol/lnaoh溶液再浸泡30分鐘,用大量去離子水反復(fù)浸洗至ph值中性。處理完畢后,進行濕法裝柱,用去離子水0.5mol/Lnacl溶液,去離子水依次分別平衡(流速1.0ml/min)2一3個柱體積備用.
糖樣100mg溶于5ml的去離子水中,離心除去不溶物,上樣于DeAe一52一纖維素陰離子
-1層析柱(2.6x30cm,cl型),分別采用去離子水0.1和0.3mol/LnacI溶液進行分段梯度洗脫,
流速1.0ml/min,自動收集器分部收集(10ml/管),每梯度20管。用硫酸一苯酚法跟蹤檢測各管多糖含量(490nm處吸收值),以收集的管數(shù)為橫坐標。吸光值(490nm)為縱坐標繪制DeAe一52一纖維素色譜柱洗脫曲線。依據(jù)洗脫峰型,合并相同組分,50℃旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)濃縮,對去離子水透析48h以去除nacI及小分子雜質(zhì),最后將透析內(nèi)液冷凍干燥,得初步純化產(chǎn)品。
初步純化多糖得率計算公式:
多糖得率(%)=純化多糖質(zhì)量/粗多糖質(zhì)量x100%
葡聚糖凝膠層析純化
采用sephadexg-100凝膠層析法對DeAe-52一纖維素初步純化的不同組分的多糖樣品進一步純化。葡聚糖凝膠(sephadexg一100)的預(yù)處理:稱取sephadexg一100凝膠干粉,加入30倍體積質(zhì)量比(ml/g)的去離子水,沸水浴5小時使其溶脹。冷卻后用去離子水反復(fù)浸洗,減壓脫氣后進行濕法裝柱,用0.1mna2so4;溶液平衡(流速0.25ml/min)2一3個柱體積備用。
分別稱取經(jīng)DeAe一纖維素一52初步純化的各多糖組分樣品20mg,溶于2ml0.1mna2so4溶液中,上樣于sephadexg一100層析柱(2.6x60cm)用0.1mna2so4溶液溶液洗脫,流速0.25ml/min,分步收集(5ml/管)。
用硫酸一苯酚法跟蹤檢測各管多糖含量(490nm處吸收值),以收集的管數(shù)為橫坐標。吸光值(490nm)為縱坐標繪制sephadexg一100色譜柱洗脫曲線。依據(jù)洗脫峰型,合并相同組分,50℃旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)濃縮,對去離子水透析48h以去除na2so4;及小分子雜質(zhì),最后將透析內(nèi)液冷凍干燥,得不同純化產(chǎn)品。
純化多糖得率計算公式:
純化多糖得率(%)=純化多糖質(zhì)量/粗多糖質(zhì)量x100%
(鮑氏層孔菌菌絲體粗多糖)
(4)紙層析法呈單一集中斑點。
取0.5%的多糖樣品溶液50ul,點樣于新華中速濾紙(3cmx20cm)距端點1cm處的中部,以正丁醇:濃氨水:水(4o:50:5)為展開劑,飽和2小時以上,在室溫下展開6h,取出吹干,用0.5%甲苯胺藍液染色,立即用95%乙醇漂洗至背景褪色,看是否只有一個清晰的斑點。
(5)瓊脂糖(Agarose)凝膠電泳法
在瓊脂糖板(厚度為0.2cm)上點樣3一5ul采用濃度為0.075mol/L,ph8.6的巴比妥緩沖液,電泳1-1.5h,電壓為64一80V,甲苯胺藍(濃度為1%)染色,醋酸乙醇混合溶液(醋酸:乙醇:水=0.1:5:5)脫色。多糖純品經(jīng)電泳展開后,看是否呈現(xiàn)單一斑點,斑點是否清晰。
(6)紫外分光光度法
將多糖pwZ加0.9%nacI溶液溶解,配成濃度為1mg/ml的溶液,采用uV一16oA紫外可見光譜儀掃描(200nm一30onm)觀察260nm、280nm處是否有吸收峰。
多糖的分子量測定:
過去用超速離心沉降法、光散射法、滲透壓法、粘度法(:多糖質(zhì)譜鑒定)等,這些方法操作復(fù)雜且誤差較大,現(xiàn)已少用?,F(xiàn)在較常用的方法有凝膠過濾法和高效凝膠液相色譜法,這兩種方法須先用已知分子量的標準多糖對照測定樣品的分子量。
一般來說,多糖結(jié)構(gòu)分析包括以下幾點:
(1)單糖組成分析:研究確定單糖的種類及摩爾比;
完全酸水解后用高效液相色譜方法(hpLc)或氣相色譜方法測定。
(2)糖苷鍵類型:研究確定糖苷鍵及支鏈點連接位置;
甲基化分析方法
高碘酸氧化法與smith降解法
(3)糖環(huán)大?。貉芯看_定糖苷鍵為呋喃糖或吡喃糖;
紅外光譜
(4)異頭碳構(gòu)型:研究確定糖苷殘基的a-或p-構(gòu)型;
2DnmR.(TwodimensionalnuclearmagneticResonance)光譜分析方法測
(5)確定單糖殘基和重復(fù)單元的序列
甲基化分析方法與磁共振光譜分析方法結(jié)合分析,一般會參考多糖的單糖組成及摩爾比信息以利于解析多糖結(jié)構(gòu)。
高碘酸氧化法
薄層層析(TLc)——定性,
氣相色譜法
(6)取代基團位點:研究0h-修飾基團的種類和取代位點,如0-磷酸化,乙丑基取代,0-
硫酷化等;
比色分析方法
(7)多糖分子量分布的研究。
紫外光譜
定性與定量方法
薄層層析:殘基定性
氣相色譜:殘基定量
氣質(zhì)聯(lián)用:殘基定量
高效陰離子色譜法:殘基定量
鑒定結(jié)構(gòu)常用物理化學(xué)方法:
高效液相色譜:確定單糖組分和相對分子量
紅外光譜分析:測定多糖的官能團,不僅可以檢測酮糖、酵糖的恥喃糖環(huán)或呋喃糖環(huán)的構(gòu)象和糖苷鍵的構(gòu)型
核磁共振:α-構(gòu)型與β-構(gòu)型殘基的比例;判斷異頭碳構(gòu)型;推斷主鏈和支鏈連接鍵型鑒定結(jié)構(gòu)復(fù)合方法:
甲基化分析:推斷出多糖樣品中糖基的連接方式及各種連接鍵型的比例
高碘酸氧化法與smith降解法:判斷糖苷鍵的位置、直鏈多糖的聚合度及支鏈多糖的分支數(shù)目
糖睛乙酸酷衍生物的氣相色譜法:單糖組成和摩爾比
各種多糖化學(xué)結(jié)構(gòu)鑒定方法的具體實施方案
1、酸水解
(1)完全酸水解
-1稱取20mg樣品,加入2mL2mol·L的h2so4于安培管中沸水浴水解8h,水解液用
baco3中和至ph=7,離心,取上清夜置冰箱冷藏備測。(阿魏側(cè)耳子實體多糖分離純化及其化學(xué)結(jié)構(gòu)的初步研究)
(2)部分酸水解
稱取糖樣70mg,80℃條件下,0.05m三氟乙酸水解2h。降至室溫后,離心(4000r/min,10min),將沉淀干燥,留做gc分析。上清用無水乙醇除酸至中性(ph為6~7),蒸餾水透析48h:將袋外透析液濃縮,真空干燥,留做gc分析;袋內(nèi)液濃縮至5ml左右,加10倍體積無水乙醇,醇沉過夜,離心(4000r/min,10min),沉淀常規(guī)干燥,作gc分析;上清濃縮,真空干燥,留做gc分析。
2、高效液相色譜
確定樣品的單糖組成
色譜條件為:
色譜柱為shodexKs804sugar(300mm×7.8mm)
柱溫40度
流動相為水
-1流速0.8mL·min
檢測用410RⅠ示差檢測器,數(shù)據(jù)處理用810gpc軟件進行。
同時用鼠李糖、阿拉伯糖、甘露糖、半乳糖、木糖、果糖、葡萄糖、巖藻糖8種單糖進
行對照,根據(jù)峰值確定樣品的單糖組成。
分子量的測定以標準分子量的葡聚糖pulluan作分子量測定標準。讓其通過高壓液相色譜柱,條件同上,先以分子量對數(shù)與對應(yīng)的保留時間作標準曲線,從標準葡聚糖pulluan的工作曲線上可以求得該成分分子量。
例如:(阿魏側(cè)耳子實體多糖分離純化及其化學(xué)結(jié)構(gòu)的初步研究)
將水解后的多糖樣品pw2進行hpLc分析,結(jié)果如表所示:阿魏側(cè)耳子實體多糖pw2經(jīng)過酸水解后,得到2種單糖:葡萄糖和半乳糖,摩爾比例1.77∶1。
例如:
4經(jīng)hpLc測定后對照標準曲線得多糖pw2的分子量為3.18×10。(阿魏側(cè)耳子實體多糖
分離純化及其化學(xué)結(jié)構(gòu)的初步研究)
4、甲基化分析
(1)基本原理
先將多糖中各種單糖殘基中的游離羥基全部甲基化,然后將多糖中的糖苷鍵進行完全酸水解,水解后得到的化合物,其羥基所在的位置,即為原來單糖殘基的連接點。同時根據(jù)不同甲基化單糖的比例,可以推測出此種連接鍵型在多糖重復(fù)結(jié)構(gòu)中所占的比例。
用此種方法得到的羥基及nabh4還原醛基后產(chǎn)生的羥基,經(jīng)乙?;傻玫郊谆奶谴家宜狨?此產(chǎn)物易揮發(fā),可進行g(shù)c分析),再經(jīng)gc與gc-ms分析,通過氣相色譜的出峰順序和對質(zhì)譜譜圖的主要離子碎片的分析便可以較準確地確定糖的連接鍵型。
反應(yīng)通式如下
:
(2)甲基化反應(yīng)
取充分干燥的多糖樣品10mg,溶解在2.0ml的二甲基亞礬(Dmso)中。在n2保護下快速加入干燥的naoh粉50mg,用n2排出空氣,加蓋密封,室溫反應(yīng)1.0h并間歇振蕩。在n2保護下緩慢滴加碘甲烷1.0ml,用n2排出空氣,加蓋密封,室溫繼續(xù)反應(yīng)1.0h并間歇振蕩,反應(yīng)完成后加0.5ml水終止反應(yīng)。反應(yīng)液先用自來水流水透析48h,再用蒸餾水透析24h,透析液冷凍干燥得第一次甲基化樣品。第一次甲基化樣品繼續(xù)甲基化,反應(yīng)步驟同上,得第二次甲基化樣品。如此重復(fù)甲基化三次。甲基化后的樣品用紅外光譜檢測,3700
cm-1—3100cm-1,附近無羥基的特征吸收峰,表明甲基化反應(yīng)完全。
(3)甲基化樣品的衍生化
上述完全甲基化多糖樣品加入2mol/1的三氟乙酸(TFA)3.0ml,120℃密閉水解2.0h。冷卻后50℃減壓蒸發(fā)干,加2.0ml甲醇再蒸發(fā)干,重復(fù)三次,最后蒸發(fā)干得完全甲基化多糖的水解產(chǎn)物。加蒸餾水2.0ml使其溶解,再加硼氫化鈉25mg,振蕩后室溫還原反應(yīng)2.0h。反應(yīng)完后滴加0.1mol/1醋酸分解過量的硼氫化鈉并調(diào)ph值至5.5~7.0弱酸性。反應(yīng)液50℃減壓蒸發(fā)蒸干,加2.0ml甲醇再蒸干,重復(fù)三次,最后蒸發(fā)干。
上述蒸發(fā)干樣品加入1.0ml醋酸酐和1.0ml吡啶,封管后在沸水浴中反應(yīng)1.0h。反應(yīng)液50℃減壓蒸發(fā)干,加2.0ml甲醇再蒸發(fā)干,重復(fù)三次,最后蒸發(fā)干。加入丙酮1.0ml,用0.45ul尼龍微孔濾膜過濾,取樣進行g(shù)c/ms分析。
(4)衍生化樣品的gc/ms分析
多糖樣品經(jīng)甲基化、水解、還原、乙酰化后得到甲基化糖醇乙酸酯,進行g(shù)c/ms聯(lián)機分析,根據(jù)文獻的相對保留時間和不同單糖的主要離子碎片(m/e),推斷出多糖樣品中糖基的連接方式及各種連接鍵型的比例。
本實驗采用的條件為:gc(Variancp3800型)和ms(Variansatum2200型)氣相一質(zhì)譜聯(lián)用儀,Db-5ms石英毛細管柱(30mx0.25mmx0.25um);程序升溫,初溫80℃,保持1min,以8℃/min升至210℃,保持1min,再以20℃/min升至260℃,保持1min;氦氣作載氣,進樣口溫度250℃,分流比1:50,柱流速1.0ml/min;電子電離源(eI源)70eV,倍增器電壓350V,燈絲電流250uA,接口溫度260℃,離子源溫度180℃,質(zhì)荷比(m/z)掃描范圍30~450,掃描速率2.5scan/sec。(胞式層孔菌菌絲體多糖分離純化、結(jié)構(gòu)鑒定及其生物活性研究)
流程圖如下:(mAep-2a-2b是安絡(luò)小皮傘菌絲體多糖的某個過程中第某個樣品)
篇二:1多糖含量檢測
億信檢測推出單糖組成方案
簡介:gc-ms(氣相質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)測定單糖組成)
1多糖含量檢測
方法:苯酚-硫酸法是利用多糖在硫酸的作用下先水解成單糖,并迅速脫水生
[img]桿狀病毒-昆蟲細胞蛋白表達服務(wù)案例—鐘鼎生物
一、實驗設(shè)計?
按照客戶的預(yù)期,期望通過桿狀病毒-昆蟲細胞蛋白表達系統(tǒng)以胞外分泌的形式獲得目的蛋白,因此我們分析客戶提供的Target-Gene序列,整個蛋白序列呈親水性,自身不帶信號肽序列,并且序列本身含有昆蟲細胞的稀有密碼子,因此我們設(shè)計思路為:
1.1、以客戶的基因序列翻譯的蛋白序列為源模板,通過密碼子優(yōu)化一套最適宜SF9細胞系的基因序列。
1.2、在蛋白序列N端添加GP67信號序列幫助蛋白穿膜分泌表達至胞外,在C端添加6XHis-Tag便于重組蛋白的檢測和親和純化。
依據(jù)上述設(shè)計思路,以基因合成的方式構(gòu)建pFast-bac1-target-gene表達質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化后通過藍白篩選方法獲得重組的Bacmid,經(jīng)PCR鑒定之后轉(zhuǎn)染sf9細胞,以獲得P1代病毒和P2代病毒。侵染200ml小試表達,通過western blot檢測蛋白表達情況,確認蛋白表達情況,再通過Ni-resin親和純化獲得80%以上目的蛋白。
二、試劑和耗材
轉(zhuǎn)染試劑(購自invitrogen公司);培養(yǎng)基(購自HYclone公司);抽提試劑盒(購自Axygen公司);PCR試劑盒(IO-RAD公司);血清(購自invitrogen公司);六孔板(購自corning公司);細胞培養(yǎng)瓶(購自corning公司);離心管(購自corning公司);PCR反應(yīng)管(購自Fisher公司);Agarose(購自上?;蚬?;DNA膠純化試劑盒、質(zhì)粒小提試劑盒(購自AXYGEN公司);低熔點瓊脂糖(購自sigma公司);中性紅(購自碧云天生物公司);其它試劑均為國產(chǎn)分析純。
三、主要實驗儀器
Allegra 21R 臺式高速冷凍離心機 (美國BECKMAN公司),臺式高速離心機(德國SORVAL公司),Biologic LP層析系統(tǒng)、Mini Protean II垂直平板電泳系統(tǒng)、Gel Doc2000成像系統(tǒng)、水平電泳系統(tǒng)(美國BIO-RAD公司),PTC-200基因擴增儀(美國MJ Research公司)
320-S pH計(美國Mettler Toledo公司),AR5120電子天平(美國AHOM S公司),MultiTemp III 恒溫水浴鍋、Hofer ΜV-25紫外透射儀(美國Amersham Pharmacia公司),雪花狀制冰機(日本SANYO公司),JY92-2D超聲波細胞粉碎機(中國新芝科器研究所),蛋白核酸檢測儀(南京大學(xué)普陽科學(xué)儀器廠),超凈工作臺(中國蘇凈集團),NANODROP2000(美國Thermo公司)
四、蛋白性質(zhì)分析
4.1 客戶提供原始基因序列
GTGGGGTGCT******NNNNNNNNNNNNNN---------涉及客戶研究內(nèi)容,不予顯示----NNNNNNNNNNNNNNN*******CTTCTCCCTT
4.2 編碼的蛋白序列如下(理論分子量41.18KD,理論等電點PI6.73)
GCSVDFSK******NNNNNNNNNNNNNN---------涉及客戶研究內(nèi)容,不予顯示----NNNNNNNNNNNNNNN*******TAGSTDHMDHFSL
4.3 稀有密碼子序列分析如下圖所示(紅色:使用頻率低于10% 灰色:使用頻率低于20%,綠色為正常頻率密碼子)
4.4 蛋白序列跨膜及親疏水性分析
4.5 信號肽預(yù)測
綜上所述:
1、蛋白理論分子量為 41KD,屬于正常分子量范圍,較適宜表達。
2、通過對基因密碼子使用頻率的分析,如果以293細胞為表達宿主,基因序列上使用頻率低于20%的密碼子X個,使用頻率低于10%的密碼子X個,優(yōu)化后通過基因合成方式獲得目的基因。
3、通過對蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)和親疏水性分析,蛋白整體呈親水性,但從473AA之后,蛋白存在典型的跨膜結(jié)構(gòu),建議去除后表達以提高成功率。
4、目的蛋白自身無信號肽,添加GP67信號肽便于蛋白分泌表達。為了純化方便,考慮在C端添加His標簽。
五、實驗方法及實驗結(jié)果
5.1 pFast-bac1-target-gene表達質(zhì)粒構(gòu)建
采用基于PAS(PCR-based Accurate Synthesis)的方法合成target-gene基因,雙酶切連接至pFast-bac1載體的BamH I和Hind III之間;將獲得的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入TOP10克隆菌株,挑取陽性克隆子測序,測序結(jié)果拼接如下所示,單劃線區(qū)為目的基因基因區(qū)域。紫色區(qū)域為酶切位點,黃色區(qū)域為GP67信號肽,綠色區(qū)域為6XHis標簽;
g c c a c c A T G T T A C T C G T C A A C C A G A G C C A C C A A G G G T T T A A C A A G G A A C A C A C A T C C A A A A T G G T T T C A G C T A T C G T G CT T T A T G T T C T T C T T G C C G C G G C A G C T C A T T C T G C A T T C G C G A G A T T G G C T T G T A A G G A A G A T T A C A G A T A T G C C * * * * * * N N N N N N N ---略--- N N N N N N N * * * * * A T C A T C A C C A T C A C C A T C A C T A A a a g c t t
5.2 使用Chromas軟件查看測序峰圖文件,截取部分序列示例如下:
5.3 pFast-bac1-XXX質(zhì)粒酶切圖與載體構(gòu)建示意圖如下所示:
5.4 重組桿狀病毒表達載體(Bacmid,桿粒)的構(gòu)建
5.4.1 桿粒菌株轉(zhuǎn)化
DH10Bac E.coli 感受態(tài)細胞冰上解凍;(2)將200ng的pFastBac1-gene轉(zhuǎn)移載體緩慢加入感受態(tài)細胞中,輕輕混勻;(3)冰上放置30min,然后42℃熱擊90s;(4)迅速冰上靜止5min; (5)向EP管里加入900 μl S.O.C.培養(yǎng)基;(6)37℃,225 rpm震蕩搖菌4h;(7)取100μl菌液涂于含有50 mg/ml 卡那霉素,7 mg/ml 慶大霉素,10 mg/ml 四環(huán)素,100 mg/ml x-gal,and 40 mg/ml IPTG的LB平板;(8)37℃,倒置培養(yǎng)48h。
5.4.2 重組Bacmid質(zhì)粒的鑒定
挑取3個白色單克隆菌落接種分別接種于5ml含有50 mg/ml卡那霉素,7 mg/ml 慶大霉素,10 mg/ml 四環(huán)素,搖菌,菌液PCR初步篩選陽性克隆菌。小量抽取質(zhì)粒,PCR驗證桿粒正確性,因桿粒大小135Kb,酶切方式很難進行驗證,故采用PCR進行驗證,理論上,若目的基因成功轉(zhuǎn)座至Bacmid中,那擴增產(chǎn)物的大小應(yīng)為(2300bp+目的基因長度)
5.5轉(zhuǎn)染及收獲病毒
5.5.1 sf9細胞的培養(yǎng)
sf9細胞培養(yǎng)使用SF 900Ⅱ培養(yǎng)基培養(yǎng),一般每3天分瓶傳代一次。處于對數(shù)生長期細胞且細胞活力大于95%的sf9 細胞用于轉(zhuǎn)染實驗。
5.5.2 Sf9細胞凍存方法:
細胞培養(yǎng)至對數(shù)生長期,活力超過90%; 計數(shù),使得儲存濃度為1×107 /ml至2×107 /ml; 準備所需量的儲存培養(yǎng)液,加DMSO至10%和FBS至30%,預(yù)冷培養(yǎng)液保存于4℃; 離心懸浮細胞或單層細胞 100×g,5min,用預(yù)冷的凍存液懸浮至所需密度; 混勻,分裝至凍存管; 將凍存管放入填有脫脂棉的泡沫盒,-80℃放置1天;移入液氮罐中保存。
5.5.3 Bacmid轉(zhuǎn)染sf9細胞
(1)在六孔板中接種9×105個細胞/2ml/孔。其中培養(yǎng)基Grace’s medium中含有青霉素50U/ml,鏈霉素50ug/ml,10%FBS;
(2) 27℃培養(yǎng)1h,使細胞貼壁;?
(3) 在這期間制備Bacmid與Cellfectin Reagent復(fù)合物:
A. 用100ul不完全Grace’s medium(不含雙抗、FBS)稀釋1ug Bacmid(約5ul);?
B. 在使用前將Cellfectin Reagent倒置5~10次,使其充分混勻,取6ul Cellfectin Reagent用100ul不完全Grace’s medium(不含雙抗、FBS)稀釋;?
C. 將上述兩種稀釋液合并(總體積約210ul),輕輕混勻,室溫孵育15~45min;?
(4) 在制備Bacmid與Cellfectin Reagent復(fù)合物期間,將六孔板中的培養(yǎng)基吸掉,用2ml不完全Grace’s medium(不含雙抗、FBS)洗滌一次,去掉培養(yǎng)基;?
(5) 在含有210ul的復(fù)合物的管內(nèi)加入800ul的不完全Graces medium(不含雙抗、FBS),輕輕混勻,加到每個孔中;?
(6) 將六孔板內(nèi)的細胞孵育5h,27℃;
(7) 去掉復(fù)合物混合液,然后在每個孔中加2ml完全培養(yǎng)基(SF900含雙抗、10%FBS);
(8) 在27℃濕度培養(yǎng)箱中孵育72h或著直到細胞出現(xiàn)病毒感染跡象。上清和沉淀需要分別制備樣品,待后期western blot表達鑒定使用。
5.5.4 P1病毒液的收集
當(dāng)細胞出現(xiàn)感染跡象時,將細胞上清轉(zhuǎn)移至15ml離心管中,1000rpm離心5min以去除細胞及大的碎片,可用蛋白結(jié)合率低的0.2um的濾膜過濾,滴度損失小于10%;將含病毒的上清液轉(zhuǎn)移到另一個無菌帶蓋的EP管中(一般,P1的滴度在10^6pfu/ml左右), 將得到的病毒液體避光置于4℃冰箱(短期)。若長期保存,進行1ml分裝,避光儲存于-80℃。
5.5.5 P2病毒擴增及收獲
原代病毒滴度(P1)較低,介于1×106~1×107,擴增后滴度為1×107~1×108。 50ml搖瓶中加入適量的P1病毒。擴增病毒時可用下列公式進行計算:
MOI(Multiplicity of infection)在0.01~0.1之間,?
接種量 (ml):desired MOI (phf/ml) ×(total number of cells) tlter of viral inoculum (puf/ml)?
感染細胞48 h收集的病毒擴增的將近100倍,超過48h 收集的病毒質(zhì)量較低。每種病毒的收集時間都有一定的差別,如在72h收集,但是隨著細胞的裂解,病毒的增殖活力會受損。
5.5.6 病毒滴度檢測
六孔板中細胞120萬/孔,靜置培養(yǎng)1h,病毒梯度稀釋101 102 103 104 105 106 107 108 ,去掉六孔板中的上清,取106、107、108三個滴度病毒加入到六孔板中,平行對照2組,孵育1h,配置空斑培養(yǎng)基,每孔加入2mL空斑培養(yǎng)基;第四天加入中性紅染色液;7-10天計數(shù)空斑數(shù),算病毒滴度。
5.6 重組蛋白表達純化
f9細胞以2×106/ml瓶接種于500ml細胞培養(yǎng)瓶中;待細胞生長至對數(shù)期,接P2代病毒感染sf9細胞;48~72h內(nèi)收集細胞及上清,用于重組蛋白表達的檢測。
1、依此條件方法放大培養(yǎng)。4℃ 10000g離心20 min,取上清;
2. 利用低壓層析系統(tǒng),上清液以0.5 ml/min流速上樣至Ni-IDA Binding-Buffer預(yù)平衡的Ni-IDA -Sepharose CL-6B親和層析柱;
3. 用Ni-IDA Binding-Buffer以0.5 ml/min流速沖洗,至流出液OD280值到達基線;?
4. 用Ni-IDA Washing-Buffer(20 mM Tris-HCl,20 mM咪唑,0.15 M NaCl,pH8.0)以1 ml/min流速沖洗,至流出液OD280值到達基線;
5. 用Ni-IDA Elution-Buffer(20 mM Tris-HCl,250 mM咪唑,0.15 M NaCl,pH8.0)以1 ml/min流速洗脫目的蛋白,收集流出液;
6.將上述收集的蛋白溶液加入透析袋中,使用PBS(PH7.4)進行透析過夜;
7. 進行10% SDS-PAGE分析。
5.7 Western Blot檢測
1. 樣品上樣0.01ug。
2. 上樣完畢后,聚丙烯酰胺凝膠先90V跑完積層膠,再將電壓升至200V直到電泳結(jié)束。
3. 電泳結(jié)束后,取下凝膠進行轉(zhuǎn)膜,恒壓100V轉(zhuǎn)膜,約為1.5小時。
4. 電轉(zhuǎn)結(jié)束后,取下膜后先用PBS洗滌4次,每次5分鐘。然后置于5%脫脂奶粉封閉液中封閉37℃ 1小時。
5. 用封閉液稀釋一抗,膜在一抗稀釋液中37℃反應(yīng)1小時。
6. 洗膜4次,每次5 分鐘;用含5%牛奶的封閉液稀釋二抗。膜在二抗中37℃反應(yīng)1小時。
7. 洗膜ECL顯影。
六. 實驗結(jié)果及分析
6.1 質(zhì)粒鑒定結(jié)果
6.1.1 質(zhì)粒濃度
6.1.2 PCR鑒定結(jié)果
說明:
目的基因2600bp,使用pUC/M13引物擴增產(chǎn)物理論大小為4900bp,實驗結(jié)果與預(yù)期一致。
6.2 P2代病毒蛋白表達鑒定
6.3 病毒滴度檢測,采用病毒空斑實驗方法檢測病毒滴度
說明:
P2代病毒感染sf9細胞,通過檢測細胞上清和細胞裂解液發(fā)現(xiàn):目的蛋白大部分存在上清中,正常分泌至胞外。
說明:
通過6孔板病毒空斑實驗法檢測病毒低毒,可以確認我們提供的病毒低毒達到107pfu/ml。
6.4 通過Ni-IDA-Resin親和純化目的蛋白,獲得純度約85%的目的蛋白
說明:
通過Ni-IDA-resin收集目的蛋白,經(jīng)過濃縮處理后使用SDS-PAGE檢測,得到了85%以上的目的蛋白。
說明:
通過SEC-HPLC進一步純化,獲得單一峰的目的重組蛋白,HPLC檢測純度在95%以上。
七. 發(fā)貨清單
序號類型名稱規(guī)格常數(shù)
1克隆質(zhì)粒PMD18-target gene2-4ug2
2克隆菌株P(guān)MD18-target gene in DH5 α1ml1
3表達菌株P(guān)Fast-Bac1-target2-4ug2
4桿粒bacmidBacmid-target in TOP101ml1
5P2代病毒MT 107pfu/ml1ml5
6重組蛋白MT protein 純度85%,濃度 0.5mg/ml1ml3
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HPLC的常用術(shù)語解釋
高效液相色譜法(HighPerformanceLiquidChromatography\HPLC)又稱“高壓液相色譜”、“高速液相色譜”、“高分離度液相色譜”、“近代柱色譜”等。它是在生化和分析化學(xué)中常用的柱層析儀。接下來我為大家整理了HPLC的常用術(shù)語解釋,希望對你有幫助哦!
第一部分 色譜曲線
1、色譜圖(chromatogram):色譜柱流出物通過檢測器系統(tǒng)時所產(chǎn)生的響應(yīng)信號對時間或流動相流出體積的曲線圖,或者通過適當(dāng)?shù)? 方法 觀察到的紙色譜或薄層色譜斑點、譜帶的分布圖。
2、(色譜)峰(chromatographic peak):色譜柱流出
3、峰底(peak base):峰的起點與終點之間的連接的直線
4、峰高(h ,peak height):色譜峰最大值點到峰底的距離(圖1 中的BE)。
5、峰寬(W ,peak width):在峰兩側(cè)拐點(圖1 中的F ,G)處所作切線與峰底相交兩點的距離
6、半高峰寬(W h/2 ,peak withd at half height):通過峰高的中點作平行于峰底的直線,此直線與峰兩側(cè)相交兩點之間的距離(圖1 中的HJ)。
7、峰面積(A ,peak area):峰與峰底之間的面積
8、拖尾峰(tailing peak):后沿較前沿平緩的不對稱的峰。
9、前伸峰(leading peak):前沿較后沿平緩的不對稱的峰。(又叫伸舌峰、前延峰)
10、假峰(ghost peak):除組分正常產(chǎn)生的色譜峰外,由于儀器條件的變化等原因而在譜圖上出現(xiàn)的色譜峰,即并非由試樣所產(chǎn)生的峰。這種色譜峰并不代表具體某一組分,容易給定性、定量帶來誤差。(又叫鬼峰)
11、畸峰(distrorted peak):形狀不對稱的色譜峰, 前伸峰、拖尾峰都屬于這類。
12、反峰(negative peak):也稱倒峰、負峰,即出峰的方向與通常的方向相反的色譜峰。
13、原點(origin):紙或薄層板上滴加試樣部位的中心點
14、斑點(spot):平面色譜法中,組分在展開和顯譜后呈現(xiàn)近似圓形或橢圓形的色區(qū)
15、區(qū)帶(zone):在色譜柱、紙或薄層板上被分離組分所占的區(qū)域。
16、復(fù)斑(multiple spot):一種組分展開后形成兩個或多個清晰斑點。
17、區(qū)帶拖尾(zone tailing):由于物理、化學(xué)等作用的影響,一種組分在展開后形成的彗星形狀斑點。
18、基線(base line):在正常操作條件下,僅有流動相通過檢測器系統(tǒng)時所產(chǎn)生的響應(yīng)信號曲線。
19、基線漂移(baseline drift):基線隨時間定向的緩慢變化。
20、基線噪聲(N ,baseline noise):由于各種原因而引起的基線波動。
21、統(tǒng)計矩(moment):色譜流出曲線是組分在檢測器中濃度或質(zhì)量依時間的統(tǒng)計分布曲線,響應(yīng)值對應(yīng)于分布密度。組分在柱內(nèi)遷移時間 r 次冪的數(shù)學(xué)期望稱為流出曲線的 r 階原點矩。而組分在柱內(nèi)遷移時間與平均遷移時間差的 r 次冪的數(shù)學(xué)期望稱為流出曲線的 r 階中點矩。
22、一階原點矩(first origin moment):組分在柱內(nèi)遷移時間的數(shù)學(xué)期望。當(dāng)流出曲線為對稱峰時,即為組分的保留時間。
23、二階中心矩( μ2 ,second central moment):二階中心矩為流出曲線的方差。定義為:μ2=E(t-Et)2 式中,E代表平均。
24、三階中心矩(μ3 ,third central moment):定義為:μ3=E(t-Et)3
可以表示流出曲線的不對稱程度。峰形對稱時μ3=0,前伸峰μ30 ,拖尾峰μ30.
第二部分 分離模式
1、液相色譜法(liquid chromatography ,LC):用液體作流動相的色譜法。
2、液液色譜法(liquid liquid chromatography,LLC ):將固定液涂漬在載體上作為固定相的液相色譜法。
3、液固色譜法(liquid solid chromatography,LSC ):用固體(一般指吸附劑)作為流動相的液相色譜法。
4、正相液相色譜法(normal phase liquid chromatography ,NPLC):固定相的極性較流動相的極性強的液相色譜法。
5、反相液相色譜法(reversed phase liquid chromatography,RPLC ):固定相的極性較流動相的極性弱的液相色譜法。
6、柱液相色譜法(liquid column chromatography ):在柱管內(nèi)進行組分分離的液相色譜法。
7、高效液相色譜法(high performance liquid chromatography,HPLC ):具有高分離效能的柱液相色譜法。
8、尺寸排除色譜法(size exclusion chromatography,SEC ):用化學(xué)惰性的多孔性物質(zhì)作為固定相,試樣組分按分子體積(嚴格來講是流體力學(xué)體積)進行分離的液相色譜法。
9、凝膠過濾色譜法:(gel filtration chromatography ):水或水溶液作為流動相的體積排除色譜法。
10、凝膠滲透色譜法:(gel permeation chromatography ,GPC):有機溶劑作為流動相的體積排除色譜法。
11、親和色譜法(affinity chromatography ):用連接在基體上的配位體做固定相,使其與蛋白質(zhì)或其他大分子發(fā)生可逆的高選擇性的相互作用,利用不同親和力進行分離的液相色譜法。
12、離子交換色譜法(ion exchange chromatography ,IEC):以離子交換作用分離離子型化合物的液相色譜法。
13、離子色譜法(ion chromatography ):以含有某種特定離子的水溶液作為流動相,流出液通過抑制柱(或不通過抑制柱),在降低流動相背景信號的條件下用于分離離子的液相色譜法。
14、離子抑制色譜法(ion suppression chromatography ):通過調(diào)節(jié)流動相的PH值來抑制試樣組分的電離,以分離離子型化合物的液相色譜法。
15、離子對色譜法(ion pair chromatography ):用形成離子對化合物進行分離的液相色譜法。16、疏水作用色譜法(hydrophobic interation chromatography ):用適度疏水性的固定相,以含鹽的水溶液作為流動相,借疏水作用分離生物大分子化合物的液相色譜法。
17、制備液相色譜法(preparative liquid chromatography):用能處理較大量試樣的色譜系統(tǒng),進行分離、切割和收集組分,以提純化合物的液相色譜法。
18、平面色譜法(planar chronatography):在平面介質(zhì)上進行組分分離的色譜法,也叫平板色譜法。
第三部分 ?常用術(shù)語
M:分子量
MC:二氯甲烷(methylene chloride)
MeOH:甲醇(methanol)
MS:質(zhì)譜
h:峰高
HPLC:高效液相色譜
ID:內(nèi)徑,dC
A:吸收度(式3.1,3.2);也作面積
ACN:乙腈(acetonitrile)
B(%B):二元流動相中的強溶劑(% v/v)
C8,C18:烷基鍵合相的鍵長度(八烷基或十八烷基)
CD:環(huán)糊精(cyclodextrin)
CV:變異系數(shù)(通常以%表示);式15.3
dC:色譜柱內(nèi)徑(cm)
dP:顆粒直徑(μm)
DAD:二極管陣列檢測器
EC:電化學(xué)(檢測器)
F:流速(ml/min)
FL:熒光(檢測器)
GS:梯度斜度參數(shù)(式8.2a);k*=20/GS
IEC:離子交換色譜(ion-exchange chromatography)
IPC:離子對色譜 (ion-paire chromatography)
k:保留因子(式2.4)
k*:梯度洗脫中,k的有效值或平均值(式8.1)
ka,kZ:色譜圖中,首峰(a)和末峰(z)的k值
L:色譜柱長度(cm)
LC-MS:液相色譜-質(zhì)譜
MTBE:甲基-叔-丁醚(methyl-t-butyl ether)
N:色譜柱塔板數(shù)(式2.82.8b)
N:噪音(式3.3,圖3.3)
NARP:非水反相HPLC
NPC:正相色譜
P:色譜柱壓力降(通常以psi表示)(式2.9)
pKa:酸或供質(zhì)子堿的酸性常數(shù)
PAH:多環(huán)芳烴(polyaromatic hydrocarbon)
RS:分離度(式2.1)
RI:折光指數(shù)
RPC:反相色譜
S:信號;式3.3;圖3.3;以及由式6.1定義的參數(shù)
tD:延遲或滯留時間(min,用于梯度洗脫中);等于VD/F
tG:梯度時間(min)
tR:保留時間(min)(圖2.2);等于tO(1+k)
tRa,tRz:色譜圖中首峰(a)與末峰(z)的保留時間,tR(min)(圖8.6a)
tO:色譜柱死時間(min)(式2.5)
t1,t2:相鄰譜峰1與譜峰2的保留時間(min)
TEA:三乙胺(triethylamine)
THF:四氫呋喃(tetrahydrofuran)
UV:紫外光譜
VD:延遲或滯留體積(mL);為梯度混合器與色譜柱人口之間的體積(包括混合器的體積)
Vm:色譜柱死體積(mL)(式2.6);Vm為色譜柱內(nèi)部的流動相體積,不包括附于固定相上的溶劑
Vmax:最大樣品體積(mL)(式13.1)
Va:樣品體積(mL)
w:重量(mg);也作半峰高處的峰寬(min)
wmax:不超載色譜柱的最大進樣量(mg)(式2.17)
wS:色譜柱的飽和容量(mg)(式13.4)
W:峰底寬(min)(圖2.2)
Wth:大進樣量對峰底寬的貢獻(min)(式13.2)
WO:小進樣量的峰底寬(min)
W1/2:半峰高處的峰寬(min)(圖1.1)
a:分離因子,等于k2/k1,其中k2與k1分別為相鄰譜峰2和譜峰1的k值
△tR:tRz-tR(min)
△%B:梯度洗脫期間,%B的變化
ε:摩爾吸收系數(shù)
εo:正相HPLC 中溶劑或溶劑混合液的強度
η:粘度(CP)
不常有符號
A,B,C:式2.11中的常數(shù);數(shù)值A(chǔ),B與C隨k值而變化,但改變 其它 條件或溶質(zhì)時基本不變
A,B,C:式2.10中的常數(shù);數(shù)值A(chǔ),B與C隨條件和樣品而變化
A,B,C:式2.10a中的常數(shù);數(shù)值A(chǔ),B與C隨條件和樣品而變化
C:譜峰最大值處的濃度(mol/L)
CO:注入樣品中溶質(zhì)的濃度(mol/L)
GI:化學(xué)電離(MS)
DGA:N,N-二甲基-1-萘酰胺;(也作二甲基苯胺dimethylaniline)
EI:電子電離(MS)
ELS:蒸發(fā)光散 射擊 (Evaporative light scattering)
EtOAc:乙酸乙酯(ethyl acetate)
FAB:快速原子轟擊(MS)
FD:場解吸附(MS)
h:折合板高,等于H/dP(式2.11)
HB:羥基苯甲酸(hydrxybenzoic acid)(圖7.8,7.17與7.19)
HFBA:七氟丁酸(hyptafluorobutyric acid)
IPA:異丙醇(isopropanol)
kW:以水作為流動相的k值(式6.1)
LCEC:液相色譜電化學(xué)檢測器
LD:激光解吸(MS)
LSIMS:液態(tài)二級離子質(zhì)譜
MALDI:基質(zhì)輔助激光解吸電離
MP:對羥苯甲酸甲酯
[P-]m:流動相中離子對試劑P-的濃度(mmol/L)
PAD:脈沖電流分析檢測器
PBP:極性鍵合相
PD:等離子解吸(MS)
PP:對羥苯甲酸丙酯
PTH:乙內(nèi)酰苯硫脲
R+,R-:分別為陰離子與陽離子離子交換色譜柱中的荷電功能基困(式7.4和7.5[如-N(CH3)3+和-SO3-]
RF:響應(yīng)因子
TBA+:四丁基銨離子
tBME:見MTBE
TMS:三甲基硅烷(trimethylsilyl;也為C1)
TNB:1,3,5-三硝基苯(1,3,5-trinitrobenzene)
TOF MS:時間飛行質(zhì)譜
TSP:熱噴霧(MS)
u:流動相通過色譜柱的速度(cm/s);等于L/to
V:峰底寬(mL)
Vc:色譜柱內(nèi)峰展寬對V的貢獻;也作小樣品量峰底寬(mL)(式2.16)
VR:保留體積(mL)
W:峰寬(min)(式2.12)
Wc,WS,:分別為色譜柱,進樣器,連續(xù)管和流通池對W的貢獻(min)
Wlc,Wfc:(式2.12)
X,X1,:無特征結(jié)構(gòu)的溶質(zhì)(圖7.8,7.17和7.19)
X2,X3
XB:流動相中的B溶劑的摩爾分數(shù)
V:折合速度,等于udp/Dm(式2.11)
б:高斯曲線的標準偏差;等于峰底的1/4
ι:檢測器響應(yīng)時間常數(shù)(S)
φ:流動相中B溶劑的體積分數(shù);等于0.0
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